81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1247 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  359  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  72.73 
 
 		 165 aa  248  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  64.12 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  62.07 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  66.23 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  67.5 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  61.99 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  61.99 
 
 		 184 aa  204  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  59.3 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  59.3 
 
 		 175 aa  194  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  49.69 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  47.17 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  47.17 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  47.2 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  47.8 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  45.96 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  45.96 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  45.91 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  45.96 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  45.96 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  45.96 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  41.77 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.44 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  45.06 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  45.45 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  41.77 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  38.18 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.83 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  39.62 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.29 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.87 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.23 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  39.63 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  41.62 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.79 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.37 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  40.72 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  38.79 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.31 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.49 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  41.82 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  37.95 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.47 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  38.71 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.57 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  33.76 
 
 		 447 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  38.75 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.88 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.75 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  38.67 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.42 
 
 		 157 aa  89  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  38.92 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  34.81 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  30.97 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  31.41 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  32.68 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  28.1 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  43.7 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  39.23 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.89 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.94 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.16 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  28.4 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  32.17 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.16 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  32.79 
 
 		 466 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1394  hypothetical protein  30.95 
 
 		 229 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.138559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.18 
 
 		 462 aa  40.8  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>