76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0991 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  61.54 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  62.18 
 
 		 157 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  58.33 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  60 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  59.74 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  59.74 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  60 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  59.74 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  61.29 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  58.44 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  57.79 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.25 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  50.64 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  50.32 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  53.09 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  53.09 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.27 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  50.34 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  47.73 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.37 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  48.8 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  46.79 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.06 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.72 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  47.9 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.22 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  43.14 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  41.03 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  48.41 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.2 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  41.4 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.84 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  38.41 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  40.85 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  40.62 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  45.18 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  45.18 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  45.18 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  38.51 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.35 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  43.64 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  41.29 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40.37 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  37.06 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  36.91 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  36.24 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  40.36 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.93 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  36.13 
 
 		 447 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  43.23 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.9 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  34.23 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.16 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.13 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.58 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.12 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  30.72 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.37 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  38.53 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  23.76 
 
 		 466 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  28.74 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>