79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0908 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  100 
 
 		 163 aa  337  5.9999999999999996e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.98 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  42.17 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  39.74 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  42.04 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.54 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  41.4 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.45 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  41.4 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.31 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.37 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.52 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  40.88 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  39.62 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  37.01 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  39.75 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  39.62 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  38.75 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  45.21 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.97 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.12 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  38.99 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.13 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40.37 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40.37 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  40.37 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  36.69 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  40.25 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  38.51 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  40.25 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  37.34 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  41.33 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  41.45 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.61 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  33.77 
 
 		 447 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  37.42 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  37.35 
 
 		 184 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  37.35 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.76 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  34.81 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  37.41 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.99 
 
 		 168 aa  97.1  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  38.71 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  34.38 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  33.97 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.93 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.87 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  35.48 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  34.39 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.08 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.51 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.37 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.69 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  35.62 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  42.06 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.94 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  37.14 
 
 		 466 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.25 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.24 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.69 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>