22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  100 
 
 
409 aa  822    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.82 
 
 
669 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  36.6 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  29.16 
 
 
387 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  33.86 
 
 
361 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  31.25 
 
 
383 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  32.09 
 
 
383 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  31.56 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  31.97 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  31.76 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  31.76 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  31.97 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  35.53 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  31.76 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  35.09 
 
 
383 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  30.54 
 
 
344 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  28.9 
 
 
237 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27280  glycopeptide antibiotics resistance protein  27.6 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  26.27 
 
 
242 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2865  hypothetical protein  39.19 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  31.94 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  32.89 
 
 
195 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>