41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  31.67 
 
 		 383 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  32.13 
 
 		 383 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  34.24 
 
 		 384 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  32.76 
 
 		 387 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 		 669 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27280  glycopeptide antibiotics resistance protein  33.92 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  31.94 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  31.02 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  30.56 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  35.47 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  26.24 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  28.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  25.88 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  25.96 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  25.99 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  33.75 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  25.16 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  32.38 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  30.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  32.08 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  28.29 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  31.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  29.91 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0215  VanZ family protein  26.95 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  30 
 
 		 172 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  29.46 
 
 		 185 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  30.48 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1302  VanZ family protein  28.75 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  35.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  27.62 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1422  VanZ family protein  33.33 
 
 		 223 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>