105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0624 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  50.37 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  32.59 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  32.59 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  31.85 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  32.59 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  31.85 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  31.85 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  31.85 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.81 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  31.25 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.82 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0243  hypothetical protein  31.09 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.78 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  30.33 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.27 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  31.01 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.46 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  26.47 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  27.05 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  27.27 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  28 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.08 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.83 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.68 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  27.64 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.64 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  28.46 
 
 		 571 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0633  hypothetical protein  32.74 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.5 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  29.46 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  29.5 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.08 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.35 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.88 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.93 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  29.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  24.06 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2179  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.27 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 150 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0821  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000871851  normal  0.998171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0672  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  26.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.468922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.17 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3126  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  28.06 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  28.06 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>