More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2656 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  84.26 
 
 		 402 aa  706    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  85.53 
 
 		 399 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  86.51 
 
 		 402 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  87.82 
 
 		 400 aa  732    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  89.87 
 
 		 398 aa  747    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 395 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  88.32 
 
 		 400 aa  736    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  87.59 
 
 		 395 aa  734    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  60.25 
 
 		 418 aa  484  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  58.48 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  59.24 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  59.09 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  56.31 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  55.3 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  55.3 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  58.48 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  57.47 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  58.48 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  54.15 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  53.66 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  53.66 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  56.85 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  58.22 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  53.04 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  54.94 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  45.22 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  46.76 
 
 		 466 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  54.78 
 
 		 272 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  37.66 
 
 		 403 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  48.52 
 
 		 274 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  36.36 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  36.36 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  35.53 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  36.36 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  39.14 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  38.32 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  37.59 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  34.76 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36.34 
 
 		 401 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  35.64 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  34.65 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.16 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  34.98 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  34.65 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.6 
 
 		 396 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.85 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.6 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  33.84 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  33.16 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  33.25 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  31.83 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.92 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.28 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  32.6 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  32.84 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.33 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  34.74 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  33.85 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  33.5 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.08 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.36 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.36 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.36 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  32.66 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  34.01 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  33.33 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  32.58 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.63 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  30.67 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  30.89 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  30.83 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  34.17 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  34 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  32.15 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  31.82 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.49 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  32.49 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.57 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  31.76 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  33.92 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.23 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.49 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.49 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.75 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  31.82 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  34.48 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  31.6 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31.16 
 
 		 413 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  31.71 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  31.45 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  32.67 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  32.84 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.37 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.9 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  31.19 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  31.08 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  32.69 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  30.1 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>