More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0366 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  72.83 
 
 		 188 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  72.83 
 
 		 188 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  72.83 
 
 		 188 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  60.98 
 
 		 197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  61.11 
 
 		 197 aa  209  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  57.65 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  57.06 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  57.06 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  57.06 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  57.41 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  53.8 
 
 		 191 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  53.53 
 
 		 209 aa  200  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  52.94 
 
 		 198 aa  191  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  52.94 
 
 		 198 aa  191  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  52.94 
 
 		 198 aa  191  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  52.94 
 
 		 198 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  52.94 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  52.94 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  55.06 
 
 		 182 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  51.27 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  54.61 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  53.24 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  41.4 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  38.85 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  35.33 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  32.54 
 
 		 307 aa  84.7  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0382  integrase family protein  34.01 
 
 		 194 aa  84  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.71 
 
 		 295 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.19 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  34.39 
 
 		 413 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  33.12 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.91 
 
 		 296 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  29.52 
 
 		 295 aa  77.8  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.56 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 299 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 299 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.65 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.32 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  28.74 
 
 		 304 aa  74.3  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 295 aa  74.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.55 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  34.81 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  28.48 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.3 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  31.21 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  31.01 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  28.92 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.42 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  31.97 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.48 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  31.48 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 327 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 303 aa  72  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2861  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 313 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 		 295 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.88 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.41 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 302 aa  71.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 320 aa  71.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 296 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  33.77 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  30.82 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>