More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0485 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  90.48 
 
 		 421 aa  717    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0485  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 420 aa  851    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  44.36 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  44.36 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  44.36 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  45.76 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  45.32 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  45.12 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  46.7 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  42.69 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  46.21 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  44.12 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  44.99 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  44.25 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  43.72 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  44.99 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  44.25 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  45.85 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  41.93 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  44.25 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  43.03 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  43.24 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 423 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  42.58 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  44.47 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  43.03 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  40.83 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  41.45 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  43.6 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  41.32 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  41.22 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  43.44 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  42.3 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  41.22 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  42.3 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  41.93 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  42.62 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  43.13 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  41.22 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  41.89 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  41.25 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  39.85 
 
 		 423 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  42.29 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  42.17 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  41.04 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  41.55 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  41.06 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  42.17 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  40.19 
 
 		 416 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  42.34 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  41.25 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  41.5 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  42.3 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  41.89 
 
 		 414 aa  329  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  39.17 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  40.15 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0203  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.628049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  41.16 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  41.97 
 
 		 417 aa  325  6e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  38.59 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  40.82 
 
 		 414 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  40.96 
 
 		 420 aa  325  9e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 434 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  38.93 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  39.71 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 427 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  39.53 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  41.46 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  38.74 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  41.46 
 
 		 423 aa  323  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  40.29 
 
 		 419 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0666  diaminopimelate decarboxylase  39.07 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0744  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  40.78 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  39.34 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  39.34 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  41.35 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  42.24 
 
 		 401 aa  318  9e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  40.68 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  40.91 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  38.83 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  40.19 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>