236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1608 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1608  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  69.34 
 
 
142 aa  204  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  62.07 
 
 
122 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3406  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  28.17 
 
 
189 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  23.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
189 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  27.48 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  28.06 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  26.9 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  28.06 
 
 
204 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.06 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  25.17 
 
 
189 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  25.17 
 
 
189 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  25.6 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  31.07 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  25.76 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  29.29 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  26.9 
 
 
143 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  28.15 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0537  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
155 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  28.36 
 
 
185 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 
189 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  28.36 
 
 
185 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  27.92 
 
 
198 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  23.36 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 
189 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  23.7 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  28.1 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.89 
 
 
147 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  27.18 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  27.18 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  22.76 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  25.37 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  25.37 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  25.48 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  25.9 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  26.81 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  23.36 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  24.41 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  24.34 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  22.33 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  29.63 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  29.41 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  29.85 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  25.9 
 
 
194 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  23.45 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  22.06 
 
 
218 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  20.37 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  28.3 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  20.72 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  21.5 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  25.49 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  27.21 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  26.76 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  22.22 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>