More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1628 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 383 aa  735    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  50.31 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 414 aa  230  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 411 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  40.72 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  43.09 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  32.21 
 
 		 361 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  32.21 
 
 		 361 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  30.21 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  32.78 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  31.87 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  30.77 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  30.77 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  30.77 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  30.77 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  30.77 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 428 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  33.94 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  27.27 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  30.79 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  28.32 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  30 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.2 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  29.41 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  28.98 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  34.15 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  28.98 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  28.94 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  28.93 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  28.78 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  39.42 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  28.98 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  30.58 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  32.95 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  31.37 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  31.49 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  30.91 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.18 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  27.59 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  29.57 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.97 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  27.87 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.12 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  26.21 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.53 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  28.73 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.88 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  28.43 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  29.91 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>