More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1484 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  100 
 
 		 739 aa  1494    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  38.33 
 
 		 700 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  34.72 
 
 		 745 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  34.71 
 
 		 698 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  34.64 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 1055 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  34.25 
 
 		 744 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  33.73 
 
 		 747 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  33.02 
 
 		 747 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  32.52 
 
 		 753 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 		 777 aa  348  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  33.83 
 
 		 891 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 755 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  32.36 
 
 		 776 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  32.83 
 
 		 756 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  31.7 
 
 		 791 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  32.85 
 
 		 731 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 		 726 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  32.17 
 
 		 794 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 		 694 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  32.21 
 
 		 711 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  32.39 
 
 		 685 aa  295  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  31.53 
 
 		 692 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 791 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  32 
 
 		 749 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.08 
 
 		 1135 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  30.97 
 
 		 1139 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  30.92 
 
 		 1143 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 		 731 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  29.29 
 
 		 760 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  31.14 
 
 		 731 aa  250  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  30.32 
 
 		 750 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 		 760 aa  240  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.68 
 
 		 759 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 		 764 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 		 764 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  28.08 
 
 		 760 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.07 
 
 		 760 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.19 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 		 764 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 		 726 aa  230  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 		 760 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 744 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  29.34 
 
 		 726 aa  227  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 		 756 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 718 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 718 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 		 761 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.28 
 
 		 688 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  29.56 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 		 764 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 		 760 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 		 708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 		 695 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  29.68 
 
 		 727 aa  221  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  30.07 
 
 		 728 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  31.34 
 
 		 698 aa  221  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 		 697 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.11 
 
 		 685 aa  219  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  29.33 
 
 		 698 aa  218  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.31 
 
 		 708 aa  218  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  28.18 
 
 		 741 aa  217  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 		 712 aa  217  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 925 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  30.28 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.05 
 
 		 730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  34.59 
 
 		 807 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  30.33 
 
 		 703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  29.48 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.09 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.75 
 
 		 703 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  25.28 
 
 		 754 aa  209  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.04 
 
 		 961 aa  209  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 		 695 aa  208  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 		 694 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 		 691 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 		 691 aa  208  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 		 691 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 		 691 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 		 691 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.9 
 
 		 963 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  29.43 
 
 		 688 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 		 739 aa  205  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 		 691 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  27.57 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 		 738 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 		 734 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  27.43 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 		 739 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 		 701 aa  202  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>