More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0626 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0626  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0991172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0221  response regulator receiver domain-containing protein  53.57 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1344 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.86 
 
 		 1303 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.12 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2092  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  43.37 
 
 		 714 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  32.46 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 977 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1406 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1222 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 823 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 866 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 1629 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.9 
 
 		 582 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 619 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  42.17 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 639 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  34.19 
 
 		 792 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.9 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  29.31 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 803 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 798 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.78 
 
 		 1361 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 970 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1857 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2233  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 639 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  32.1 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  36.26 
 
 		 584 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 351 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  32.1 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 989 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1261 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 989 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1651 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.97 
 
 		 229 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 1202 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0844  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000136417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.59 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2352  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.55 
 
 		 1233 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1195 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  34.23 
 
 		 910 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03246  Two component CheB methylesterase  33.71 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 934 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 1046 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1896 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  33.33 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1197 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.03 
 
 		 869 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  30.34 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 984 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4464  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1362 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>