More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3430 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.41 
 
 		 455 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  100 
 
 		 464 aa  899    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  61.86 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  38.9 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 478 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 481 aa  242  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  35.48 
 
 		 471 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  35.48 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  38.88 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  30.97 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 490 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  38.04 
 
 		 456 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 484 aa  222  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  38.04 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  34.1 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  37.12 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 458 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 454 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.52 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  36.09 
 
 		 448 aa  210  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  29.16 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  31.6 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 467 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  31.03 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.31 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  41.43 
 
 		 317 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 447 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.63 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.22 
 
 		 411 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  31.32 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  31.24 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  31.94 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  29.07 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  33.5 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  32.01 
 
 		 517 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  30.28 
 
 		 442 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  35.88 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  30.14 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  27.43 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 442 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 439 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.59 
 
 		 442 aa  153  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  29.03 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>