More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2686 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  48.62 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  38.84 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  32.4 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  35.61 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  32 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  34 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.24 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.2 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  33.91 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  30.8 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.33 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  31.34 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  30 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.6 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.6 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.23 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.71 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  28.36 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  30.45 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  31.84 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.09 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  31.22 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  29.55 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.95 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  28.7 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.01 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.57 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.91 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 307 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.59 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.59 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.59 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.59 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.59 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  26.85 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.9 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.72 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  26.91 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.2 
 
 		 327 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  25.91 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  22.62 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>