More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2762 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
225 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
226 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 
226 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.48 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
226 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
230 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1428  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.84 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  28.5 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.41 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  28.02 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.35 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0352  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  25.39 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  28.5 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  25.87 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.88 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.6 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  27.6 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.03 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.23 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.4 
 
 
232 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
225 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  25.95 
 
 
225 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.49 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  24.43 
 
 
352 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0477  Crp family transcriptional regulator  24.87 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0933534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  24.87 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  26.11 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  24.35 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  24.35 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  26.98 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  23.29 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>