167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2353 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2353  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  269  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0699449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2217  response regulator receiver protein  71.54 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000010228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4095  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0512  response regulator receiver and SARP domain protein  41.6 
 
 		 128 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  35 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  32.54 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.67 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.28 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 814 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.09 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 521 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4282  PglZ domain protein  31.18 
 
 		 518 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.769544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.87 
 
 		 242 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.87 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  31.4 
 
 		 516 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.92 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3042  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 524 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.75 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  26.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 717 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1548 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 593 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.45 
 
 		 472 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.4 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.15 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 391 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  30.19 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  35.87 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  25.2 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  25.2 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  25.2 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  25.2 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  31.18 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  25.2 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.77 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 852 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.17 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0172  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 458 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833234  hitchhiker  0.00415361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  28.15 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 654 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  29.1 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 240 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  26.98 
 
 		 214 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.48 
 
 		 391 aa  43.5  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  25.42 
 
 		 1683 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  21.6 
 
 		 1765 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.11 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  29.7 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1390 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3046  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 365 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0429754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  25.98 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 846 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  27.84 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1275 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 1419 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 128 aa  42  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  31.09 
 
 		 942 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3686  response regulator  29.47 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  32.09 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.44 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1263  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  31.62 
 
 		 962 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  27.5 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  25.64 
 
 		 979 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.89 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 119 aa  42  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>