190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1631 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
393 aa  783    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  60.61 
 
 
413 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  57.78 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  56.12 
 
 
406 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  54.99 
 
 
389 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  55.32 
 
 
384 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  51.06 
 
 
388 aa  354  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  40.56 
 
 
408 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  33.42 
 
 
442 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  41.21 
 
 
408 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  32.63 
 
 
414 aa  176  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  34.93 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  31.18 
 
 
383 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  29.07 
 
 
384 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  30.83 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  29.63 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  28.61 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  28.07 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  29.17 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  27.32 
 
 
389 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  27.47 
 
 
389 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  27.27 
 
 
472 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  30.5 
 
 
385 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  26.1 
 
 
456 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  28.85 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  29.4 
 
 
386 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  29.3 
 
 
385 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  27.2 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  27.47 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  31.8 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  26.61 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  30.92 
 
 
397 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 
624 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.95 
 
 
400 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  26 
 
 
603 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 
425 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  28.31 
 
 
417 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  25.53 
 
 
448 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  25.19 
 
 
454 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  23.54 
 
 
445 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  25.19 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  26.49 
 
 
484 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  24.94 
 
 
624 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  30.85 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  25.87 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.65 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.45 
 
 
445 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.4 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.37 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  23.75 
 
 
476 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  23.92 
 
 
451 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.23 
 
 
593 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25.4 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 
471 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  28.42 
 
 
400 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  22.7 
 
 
466 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  24.39 
 
 
472 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  26.12 
 
 
382 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.88 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  23.99 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  27.98 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  21.82 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  21.98 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  25.13 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.94 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  24.02 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  28.23 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  28.23 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  23.58 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.09 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  24.93 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  20.68 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  23.48 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  28.37 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  30.57 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  20.37 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  20.37 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  24.65 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  23.97 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.27 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  27.13 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  24.72 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  23.55 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  24.79 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  24.86 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  24.31 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  23.85 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  23.85 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  23.89 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  22.05 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  24.53 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  22.19 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  23.37 
 
 
403 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>