153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1545 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  43.74 
 
 		 1321 aa  984    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  42.98 
 
 		 1358 aa  927    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  41.23 
 
 		 1319 aa  801    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  42.92 
 
 		 1306 aa  944    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  45.18 
 
 		 1336 aa  1032    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  100 
 
 		 1318 aa  2697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  41.35 
 
 		 1354 aa  947    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1459 aa  808    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  40.72 
 
 		 1331 aa  818    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  46.33 
 
 		 1219 aa  886    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  40.68 
 
 		 1712 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  43.86 
 
 		 1322 aa  958    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1338 aa  814    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  40.78 
 
 		 1373 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  39.86 
 
 		 1422 aa  853    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  40.39 
 
 		 1333 aa  866    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  45.63 
 
 		 1338 aa  1043    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  39.12 
 
 		 1322 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  43.64 
 
 		 1355 aa  1041    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  35.22 
 
 		 1343 aa  769    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1339 aa  797    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  48.6 
 
 		 1055 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1282 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1290 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  37.44 
 
 		 1442 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1243 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1250 aa  235  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1250 aa  234  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.69 
 
 		 1277 aa  201  6e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.87 
 
 		 1278 aa  198  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1375 aa  195  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1022 aa  194  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1332 aa  185  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1557 aa  179  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1581 aa  179  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  36.39 
 
 		 926 aa  176  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.82 
 
 		 1432 aa  169  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1098 aa  169  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  21.49 
 
 		 1642 aa  162  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1579 aa  159  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1612 aa  158  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1640 aa  157  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.78 
 
 		 1640 aa  151  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1426 aa  144  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1349 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.23 
 
 		 1581 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  22.39 
 
 		 826 aa  133  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1347 aa  129  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1709 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1363 aa  128  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1546 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1441 aa  122  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.73 
 
 		 1573 aa  121  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1440 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1339 aa  118  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1339 aa  118  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1751 aa  115  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1452 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1409 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1321 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1461 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1298 aa  107  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1346 aa  103  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  36.87 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1572 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1366 aa  99.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1342 aa  98.2  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1575 aa  98.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1347 aa  97.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.83 
 
 		 974 aa  95.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1353 aa  93.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1365 aa  92  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.95 
 
 		 1159 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.7 
 
 		 1089 aa  85.1  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1039 aa  74.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1209 aa  74.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1178 aa  73.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  30.46 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  34.34 
 
 		 1041 aa  70.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1036 aa  69.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.77 
 
 		 1058 aa  69.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.43 
 
 		 1256 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1210 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1154 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.48 
 
 		 995 aa  65.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.98 
 
 		 1132 aa  62.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.12 
 
 		 1186 aa  62.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  30.25 
 
 		 1189 aa  62  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.44 
 
 		 1020 aa  62  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.2 
 
 		 1244 aa  61.6  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.2 
 
 		 1257 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  36.84 
 
 		 1170 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1104 aa  60.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.19 
 
 		 1252 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.49 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  27.64 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1338 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>