174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1003 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  46.37 
 
 		 317 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  46.06 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  32.65 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  34.87 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  30.47 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  30.42 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  29.18 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.94 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.94 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  29.31 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.76 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  28.94 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  39.01 
 
 		 238 aa  116  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.88 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.94 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  33.88 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  27.98 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  31.35 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  33.69 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  30.74 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  30.33 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  33.47 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  30.33 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  27.87 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  28.18 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  29.92 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  29.92 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  34.6 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  33.52 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  33.52 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  33.52 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  33.52 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  31.69 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  27.53 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  34.97 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  29.79 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  32.97 
 
 		 239 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  38.46 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  31.36 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  25.82 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  28.51 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  34.07 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  37.91 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  27.23 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.59 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  32.83 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  32.16 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  33.15 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  33.7 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  31.02 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  31.02 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  34.48 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  27.8 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  25.71 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  29.94 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  32.26 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  35.14 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  27.16 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.11 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  25.79 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  25.79 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  32.62 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  28.98 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.26 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  26.39 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  31.55 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  30.53 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.51 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  31.19 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  22.96 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  37.1 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.41 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.98 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.98 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.78 
 
 		 170 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  24.19 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.65 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.01 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  26.7 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.07 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  34.78 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.48 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  24.73 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.37 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  23.78 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  23.78 
 
 		 173 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.12 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  30.21 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  27.81 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.65 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.37 
 
 		 166 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>