41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5403 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  63.33 
 
 
242 aa  330  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  39.64 
 
 
237 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  38.84 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  37.79 
 
 
261 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  38.01 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  35.56 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  36.65 
 
 
247 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  31.06 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  34.21 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  28.39 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  34.1 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  31.47 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
240 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.15 
 
 
241 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  30.67 
 
 
455 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  32.26 
 
 
452 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  34.67 
 
 
453 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 
440 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
1140 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.79 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
1145 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  27.4 
 
 
501 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
451 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.66 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 
1505 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  25.99 
 
 
352 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  24.9 
 
 
209 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  28.51 
 
 
453 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  24.34 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  24.28 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  22.67 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  24.12 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  32.33 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  30.36 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  23.71 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.75 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  26.32 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  24.23 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>