120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5059 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  71.57 
 
 		 416 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  55.7 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  51.14 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 426 aa  319  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  38.44 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 417 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 556 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  21.26 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  20.29 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  20.29 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  20.29 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  20.29 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  26.24 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  26.24 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.24 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.24 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  18.66 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.83 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  25 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.65 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  22.49 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  24.24 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.68 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  26 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  24.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.29 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.29 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.73 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.73 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.73 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.22 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.78 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  25.35 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  20.24 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.12 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.74 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  23.57 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  23.65 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  23.24 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  31.37 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.94 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  23.9 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.46 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  22.54 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.94 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  22.73 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  22.54 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  25.89 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  20.09 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  23.03 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  21.21 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  20.09 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  26.64 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  32.35 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.42 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>