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for query gene SO_3485 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  100 
 
 		 382 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  87.9 
 
 		 389 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  87.6 
 
 		 387 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  87.6 
 
 		 387 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  87.06 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  86.21 
 
 		 387 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  83.83 
 
 		 392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  83.02 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  53.65 
 
 		 385 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3551  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.59 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  48.42 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  48.02 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04859  hypothetical protein  48.56 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.59 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0579  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.17 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3307  multidrug resistance protein D  49.06 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.635246  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2693  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.693922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.21 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.21 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.21 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.86 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.21 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.86 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.1 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4263  MFS family transporter  36.34 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0514386  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_50050  MFS family transporter  37.13 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.012942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.2 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.92 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3477  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50 
 
 		 126 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.44 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.42 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.99 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  28.16 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.15 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.02 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.41 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  26.56 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.25 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  26.92 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.52 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.81 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.87 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.99 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.06 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.48 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.73 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.86 
 
 		 461 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.53 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.7 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 395 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  27.46 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 406 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  27.68 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  25.41 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.74 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.14 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  28.02 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  27.73 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  28.29 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  27.73 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.29 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.32 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  27.13 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.32 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.27 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.13 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  27.13 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  27.43 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
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