125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1311 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  84.77 
 
 		 243 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  47.44 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  30.6 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  38.57 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  26.09 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 288 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 155 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  27.91 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.31 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  27.91 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  27.44 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  28.68 
 
 		 130 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  28.68 
 
 		 130 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  27.01 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  28.38 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 132 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  25.88 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 125 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  27.92 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.85 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  32.17 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  40 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  30.85 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 145 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  23.64 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 142 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 140 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 147 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>