263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0624 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  90.26 
 
 		 308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  90.26 
 
 		 308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  89.94 
 
 		 308 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  41.18 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.67 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.35 
 
 		 318 aa  231  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.18 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.2 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.86 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.98 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.19 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  38.46 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.12 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.13 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0564  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.11 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  37.12 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  38.52 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.91 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.81 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.82 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.3 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.61 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  37.55 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  34.91 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  35.06 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.5 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.49 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  36.15 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  36.15 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.4 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.23 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  35.81 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.36 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.79 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  35.81 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.75 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.17 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  35.81 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.1 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  35.06 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.83 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.05 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  36.65 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.28 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.59 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  31.75 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.05 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.74 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0649  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.01 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  33.8 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.89 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.44 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.13 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.93 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.67 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  34.47 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.02 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.31 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.49 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.9 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.36 
 
 		 369 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.67 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.56 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  34.03 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.33 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  35 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.56 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.57 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  36.19 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  36.53 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  35.97 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.15 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  34.63 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0232  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.04 
 
 		 334 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.700118  normal  0.268973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.29 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.42 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.47 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.09 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  34.96 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.97 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  35.82 
 
 		 340 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.94 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  31.35 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.58 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.8 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.96 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.91 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.95 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.23 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  36.13 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>