285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2075 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  47.09 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  48.77 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 218 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.68 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  40.44 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.59 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  37.17 
 
 		 492 aa  141  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.11 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 365 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 365 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  34.48 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 365 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.26 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  34.55 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.14 
 
 		 383 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  40.31 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  37.2 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  41.99 
 
 		 535 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  33.18 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  37.65 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  35.44 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  35.27 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  35.1 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  32.73 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.53 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  37.02 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  42.39 
 
 		 204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  37.68 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  34.19 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  34.69 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.67 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  35.96 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  37.2 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  34.68 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  33.84 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  34.62 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.12 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  35.88 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  35.88 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  35.88 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  41.4 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  42 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  35.88 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.66 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  33.94 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  34.18 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  35.8 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>