More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0827 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  37.12 
 
 		 1015 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.12 
 
 		 1016 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.58 
 
 		 1118 aa  876    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  37.16 
 
 		 1015 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.12 
 
 		 1016 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.04 
 
 		 1023 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  39.3 
 
 		 1010 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.57 
 
 		 1066 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.12 
 
 		 1016 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.75 
 
 		 1061 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0862  molydopterin dinucleotide-binding region  47.97 
 
 		 861 aa  770    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.22 
 
 		 1015 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5600  formate dehydrogenase  44.06 
 
 		 861 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.758687  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3728  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.38 
 
 		 1063 aa  910    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0214561  normal  0.0673651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5276  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.71 
 
 		 1095 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.91 
 
 		 1013 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.24 
 
 		 1039 aa  922    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  44.84 
 
 		 889 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  39.36 
 
 		 1010 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  38.45 
 
 		 1014 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0824  formate dehydrogenase  47.25 
 
 		 864 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2181  molydopterin dinucleotide-binding region  44.95 
 
 		 862 aa  742    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.72 
 
 		 1011 aa  686    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.95 
 
 		 1022 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.53 
 
 		 1028 aa  674    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.81 
 
 		 1023 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.12 
 
 		 1016 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 		 1014 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3575  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.95 
 
 		 883 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 1050 aa  2188    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.49 
 
 		 1084 aa  898    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.43 
 
 		 1005 aa  691    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2291  formate dehydrogenase  43.85 
 
 		 870 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.12 
 
 		 1015 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  37.28 
 
 		 1016 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5220  formate dehydrogenase  44.21 
 
 		 865 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  47.57 
 
 		 847 aa  757    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.16 
 
 		 1015 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.26 
 
 		 1096 aa  932    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.53 
 
 		 1028 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1602  Formate dehydrogenase  44.01 
 
 		 956 aa  710    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.64 
 
 		 1096 aa  938    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.02 
 
 		 1010 aa  721    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.81 
 
 		 1016 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04200  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  45.68 
 
 		 920 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0456011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0344  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 		 905 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 		 1012 aa  706    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.44 
 
 		 1012 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 		 1015 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5830  formate dehydrogenase  46.55 
 
 		 853 aa  774    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.61 
 
 		 1009 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.9 
 
 		 1015 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.93 
 
 		 1016 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  37.12 
 
 		 1016 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5308  formate dehydrogenase  43.94 
 
 		 861 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418096  normal  0.849616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.56 
 
 		 1012 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 1003 aa  696    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 1005 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 1008 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.51 
 
 		 1059 aa  693    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.44 
 
 		 1010 aa  707    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.86 
 
 		 1100 aa  897    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.59 
 
 		 1004 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.59 
 
 		 1004 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.54 
 
 		 1020 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.54 
 
 		 1020 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 		 1018 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  36.39 
 
 		 993 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.07 
 
 		 1015 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.69 
 
 		 1026 aa  629  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 1016 aa  629  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.35 
 
 		 1023 aa  622  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  36.83 
 
 		 1005 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.52 
 
 		 1015 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.61 
 
 		 1015 aa  619  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.94 
 
 		 803 aa  618  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.46 
 
 		 1058 aa  617  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 993 aa  615  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  36.53 
 
 		 1004 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.13 
 
 		 1015 aa  611  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  36.22 
 
 		 993 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.04 
 
 		 816 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 		 802 aa  592  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  40.45 
 
 		 808 aa  582  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  38.3 
 
 		 851 aa  582  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.41 
 
 		 804 aa  582  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.69 
 
 		 824 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  37.59 
 
 		 811 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 		 842 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  38.11 
 
 		 780 aa  556  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  37.9 
 
 		 808 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  39.57 
 
 		 798 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  37.38 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  37.91 
 
 		 821 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.15 
 
 		 811 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 840 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.53 
 
 		 824 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.24 
 
 		 820 aa  535  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  36.86 
 
 		 822 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.31 
 
 		 809 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>