More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2560 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  71.03 
 
 		 215 aa  333  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  70.56 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.55 
 
 		 225 aa  324  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  71.15 
 
 		 212 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  70.19 
 
 		 216 aa  322  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  70.19 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  66.82 
 
 		 213 aa  314  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  66.51 
 
 		 220 aa  314  7e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  67.44 
 
 		 213 aa  309  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  64.79 
 
 		 224 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  64.42 
 
 		 224 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  63.55 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  61.64 
 
 		 221 aa  300  9e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  64.9 
 
 		 221 aa  299  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  64.42 
 
 		 225 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  63.13 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  61.06 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.79 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  63.46 
 
 		 215 aa  291  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  60.38 
 
 		 215 aa  285  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  58.96 
 
 		 223 aa  285  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  57.8 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  61.4 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  61.68 
 
 		 217 aa  275  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.21 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.22 
 
 		 216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  61.68 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  61.68 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  59.35 
 
 		 217 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  59.35 
 
 		 213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  57.75 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  56.25 
 
 		 230 aa  260  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.21 
 
 		 224 aa  258  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  55.5 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  53.55 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  50.23 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  53.11 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  52.4 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.52 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  51.72 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  49.54 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  50.96 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.56 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  49.77 
 
 		 229 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  49.53 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  49.31 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  50.24 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  49.77 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  47.09 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  48.56 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.5 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.61 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.91 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.26 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  49.77 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  44.34 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  47.47 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  42.16 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.37 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  42.16 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.91 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.83 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  41.67 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  36.95 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.27 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  43.96 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  40.98 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.86 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  43.08 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  40.61 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  42.42 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41.92 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  40.4 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  40.4 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  41.41 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  40 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  40.91 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  40 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  41.41 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.91 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  41.54 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  40.91 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  39.9 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  39.39 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  39.39 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  43.16 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  40.51 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  38.07 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  40.5 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.9 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  40.4 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  40.4 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>