More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1789 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1789  EAL domain protein  100 
 
 
524 aa  1078    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0608  putative signaling membrane protein  26.82 
 
 
516 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.201434  normal  0.689714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  26.97 
 
 
529 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2526  EAL domain protein  27.36 
 
 
526 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3097  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.31 
 
 
533 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  28.29 
 
 
529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36260  putative signal transduction protein  27.43 
 
 
531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104592  hitchhiker  0.00880546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  36.62 
 
 
542 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2578  EAL domain protein  27.77 
 
 
514 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  36.1 
 
 
535 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  36.1 
 
 
532 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  36.1 
 
 
535 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  28.76 
 
 
530 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  26.12 
 
 
544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  27.43 
 
 
538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  26.45 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  33.94 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  27.74 
 
 
525 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  25 
 
 
530 aa  163  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  38.69 
 
 
520 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.38 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2617  EAL domain-containing protein  24.52 
 
 
517 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.802408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  37.45 
 
 
516 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.49 
 
 
518 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.47 
 
 
498 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.11 
 
 
516 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  28.3 
 
 
516 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  28.11 
 
 
516 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  28.11 
 
 
516 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.11 
 
 
518 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  36.09 
 
 
406 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  26.94 
 
 
528 aa  156  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  37.45 
 
 
516 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  37.45 
 
 
516 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  37.45 
 
 
516 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.89 
 
 
528 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  37.07 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.2 
 
 
533 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.2 
 
 
516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  26.77 
 
 
536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.94 
 
 
528 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.65 
 
 
646 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.2 
 
 
533 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.8 
 
 
533 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.2 
 
 
533 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0660  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.05 
 
 
644 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.793092  normal  0.542598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.05 
 
 
644 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0290676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.84 
 
 
528 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  33.59 
 
 
537 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  35.15 
 
 
522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  25.85 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.59 
 
 
645 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0726  GGDEF family protein  34.29 
 
 
627 aa  147  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  32.31 
 
 
374 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  24.62 
 
 
522 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.33 
 
 
1144 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.07 
 
 
818 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4066  diguanylate phosphodiesterase  30.64 
 
 
517 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  24.62 
 
 
530 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.73 
 
 
919 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.11 
 
 
871 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.13 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06514  sensory transduction protein kinase  30.5 
 
 
495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001211  sensory box/GGDEF family protein ScrC (involved in swarmer cell regulation)  35.92 
 
 
776 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.13 
 
 
796 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1934  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.92 
 
 
692 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.2 
 
 
1027 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3696  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.38 
 
 
747 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0758  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.85 
 
 
839 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.41 
 
 
454 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.965104  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.27 
 
 
774 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3824  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.92 
 
 
877 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668765  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2848  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.54 
 
 
630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1508  hypothetical protein  35.25 
 
 
840 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.75 
 
 
865 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3177  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.88 
 
 
523 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.217843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  30.16 
 
 
532 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  30.16 
 
 
532 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0498  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.01 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.617113  normal  0.576496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0672  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.74 
 
 
646 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0430  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.93 
 
 
449 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0533  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.71 
 
 
970 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.935916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.61 
 
 
643 aa  133  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3384  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.76 
 
 
829 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5300  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.15 
 
 
710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.23 
 
 
883 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.660449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0429  GGDEF domain-containing protein  32.2 
 
 
648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11384  hypothetical protein  31.2 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.97 
 
 
607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04999  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.2 
 
 
775 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.33 
 
 
650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1366  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.8 
 
 
738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0233  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  30.04 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000170  GGDEF family protein  32.16 
 
 
636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.580711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.5 
 
 
687 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.25746  normal  0.789676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>