270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0571 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  80.09 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  73.13 
 
 		 228 aa  347  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  73.89 
 
 		 228 aa  341  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  73.13 
 
 		 228 aa  340  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  69.6 
 
 		 228 aa  330  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  67.84 
 
 		 228 aa  330  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  69.16 
 
 		 228 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  69.16 
 
 		 228 aa  328  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  70.09 
 
 		 229 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  327  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  327  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  327  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  69.16 
 
 		 228 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  69.16 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  69.16 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  68.72 
 
 		 228 aa  307  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4850  putative RNA methyltransferase  68.32 
 
 		 203 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0238546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  45.58 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1753  putative RNA methyltransferase  45.91 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005917  hitchhiker  0.00815274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  42.55 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.52 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.58 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.01 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  40.52 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.48 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.41 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.75 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  31.67 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  37.72 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.91 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.79 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.76 
 
 		 353 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.95 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.17 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  39.47 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  39.74 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.17 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  38 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.07 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.66 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  35.36 
 
 		 286 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.66 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.52 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.67 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 245 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.06 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  37.33 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  37.42 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  38 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  38 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 279 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.91 
 
 		 278 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  42.21 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  37.42 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  38 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  38 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  31.96 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  38 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  31.4 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  31.4 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  36.77 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  38 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  37.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.51 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  36.77 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  38 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  38 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 262 aa  99  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.96 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.1 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  35.33 
 
 		 243 aa  98.2  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.69 
 
 		 276 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.13 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.61 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  37.89 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 303 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>