More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1461 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  80.74 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  80.89 
 
 		 246 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  77.96 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  73.98 
 
 		 246 aa  377  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  75.52 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.58 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  69.14 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  67.77 
 
 		 248 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  66.94 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  67.21 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.3 
 
 		 259 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  67.08 
 
 		 243 aa  324  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.36 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  63.64 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  66.12 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  64.58 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  64.58 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  65.02 
 
 		 243 aa  321  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.17 
 
 		 244 aa  320  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 		 249 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  62.5 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.32 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.49 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 242 aa  317  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.51 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.41 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  62.2 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.9 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.92 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.74 
 
 		 246 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.83 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.66 
 
 		 243 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  60 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.83 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.34 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.92 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  60 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 269 aa  311  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  64.34 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.76 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.79 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  62.08 
 
 		 251 aa  311  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  59.43 
 
 		 261 aa  310  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  62.24 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  60.67 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  61.22 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.37 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  60.58 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61.92 
 
 		 263 aa  309  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  61 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.76 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  61.51 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  61.32 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  60.57 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.5 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  58.94 
 
 		 247 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  59.18 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60.83 
 
 		 246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  61.09 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.09 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.67 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.75 
 
 		 253 aa  307  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.41 
 
 		 269 aa  307  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.26 
 
 		 250 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  307  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.83 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.43 
 
 		 259 aa  306  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  58.2 
 
 		 265 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  60 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.17 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  61.73 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.94 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.85 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>