More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1529 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  100 
 
 		 476 aa  905    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  73.66 
 
 		 503 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  71.6 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  67.33 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  68.62 
 
 		 476 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  56.26 
 
 		 466 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  59.41 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  58.18 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  54.36 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  49.42 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  44.8 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 411 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.91 
 
 		 500 aa  266  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 475 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 475 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 482 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.62 
 
 		 455 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  34.62 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.17 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.4 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  34.7 
 
 		 459 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  35.01 
 
 		 442 aa  181  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  32.23 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  32.23 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 		 515 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 498 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.1 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.37 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  31.83 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30.44 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 489 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  28 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.53 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 482 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  31.97 
 
 		 490 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 532 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>