More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1140 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1140  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 418 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2333  chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03238  chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1854  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.8 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.783108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1006  methyl-accepting chemotaxis protein  25.52 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 566 aa  97.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0675  methyl-accepting chemotaxis protein  36.6 
 
 		 542 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0486909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  34.46 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 602 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 530 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 		 720 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 		 537 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  28.85 
 
 		 771 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 657 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 570 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 604 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 		 652 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 765 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 		 545 aa  91.3  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 		 657 aa  91.3  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 282 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 667 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 667 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 667 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 		 667 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 548 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 548 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 		 670 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 573 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  32.45 
 
 		 704 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 548 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.43 
 
 		 597 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3293  chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 706 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 706 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 706 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 555 aa  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 563 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 		 605 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.053685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 		 563 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  50.56 
 
 		 653 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 706 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 706 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.66 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 706 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0959  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  50.47 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  31.22 
 
 		 706 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 		 672 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2472  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.16 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0704852  normal  0.0411737 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 682 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 561 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2398  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 656 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.201842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.14 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  50.47 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 621 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.2 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 655 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  30.72 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 656 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 661 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  45.45 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 667 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 		 625 aa  88.2  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 		 689 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 		 675 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 543 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 748 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 		 674 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  37.65 
 
 		 543 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 656 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 661 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2883  chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 		 537 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.44547e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 673 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 		 566 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 650 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 571 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.8 
 
 		 716 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0322  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 541 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  34.46 
 
 		 691 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 		 566 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 		 688 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  37.02 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 688 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 567 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 563 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 731 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  43.59 
 
 		 367 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>