More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5004 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 672 aa  1374    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 		 675 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  39.97 
 
 		 666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 		 669 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 1186 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 		 650 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  31.65 
 
 		 604 aa  114  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  30.38 
 
 		 651 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  31.67 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  26.74 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  40.79 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  40.79 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  27.71 
 
 		 447 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 649 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  35.86 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  30.88 
 
 		 655 aa  108  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  30.88 
 
 		 655 aa  108  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 652 aa  107  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 657 aa  107  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 663 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 		 731 aa  107  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 545 aa  106  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0296  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  28.28 
 
 		 553 aa  105  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.79 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00889273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 662 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 651 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 665 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.79 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00946465  normal  0.0217008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  27.14 
 
 		 399 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  37.91 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  29.13 
 
 		 654 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  32.68 
 
 		 596 aa  102  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 654 aa  101  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  39.1 
 
 		 626 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.99 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152776  normal  0.082918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  36.79 
 
 		 544 aa  101  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 		 678 aa  101  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85269 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  33.51 
 
 		 656 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  34.74 
 
 		 653 aa  100  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.57 
 
 		 599 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  33.53 
 
 		 664 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  43.8 
 
 		 421 aa  99.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  29.07 
 
 		 400 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 650 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 		 680 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 650 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  39.34 
 
 		 545 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  38.56 
 
 		 236 aa  99  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 660 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3916  putative chemotaxis transducer  39.23 
 
 		 440 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46030  putative chemotaxis transducer  38.89 
 
 		 417 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 832 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  50.98 
 
 		 660 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 		 544 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 		 957 aa  97.8  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 660 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  27.01 
 
 		 389 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  39.87 
 
 		 712 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 546 aa  97.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 554 aa  97.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 		 762 aa  97.4  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.87 
 
 		 546 aa  97.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  50.98 
 
 		 660 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 		 627 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  32.47 
 
 		 678 aa  97.1  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  28.08 
 
 		 374 aa  97.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  36.7 
 
 		 480 aa  97.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 622 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 		 698 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  50.98 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  26.9 
 
 		 398 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  34.34 
 
 		 694 aa  96.3  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  26.9 
 
 		 398 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  35.33 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 		 716 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3357  putative chemotaxis transducer  32.58 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0800566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 		 706 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.78 
 
 		 677 aa  96.3  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  43.8 
 
 		 516 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  28.3 
 
 		 378 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2180  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0470297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.24 
 
 		 712 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 		 730 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  35.33 
 
 		 657 aa  95.9  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 		 660 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 626 aa  96.3  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0661  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 		 435 aa  95.9  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 515 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>