More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0962 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 		 458 aa  910    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  55.14 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  54.92 
 
 		 459 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  54.49 
 
 		 459 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  38.63 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 		 421 aa  183  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 632 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 635 aa  156  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  38.7 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  38.7 
 
 		 365 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  35.86 
 
 		 365 aa  136  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178259  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.17 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  37.79 
 
 		 375 aa  128  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 		 720 aa  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1394  chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  45.34 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4661  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.59 
 
 		 440 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 		 357 aa  120  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  34.66 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 		 720 aa  117  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 676 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0801097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 		 658 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  32.31 
 
 		 653 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  41.94 
 
 		 626 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  41.76 
 
 		 655 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.27 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  41.76 
 
 		 655 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 		 708 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4008  chemotaxis sensory transducer  29.88 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 		 751 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.05 
 
 		 670 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 748 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.82 
 
 		 682 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 		 541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 		 563 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  53.78 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 596 aa  110  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  33.22 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  34.64 
 
 		 694 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 674 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 668 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 649 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.25 
 
 		 658 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.29 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000264918 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  53.39 
 
 		 654 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 667 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  37.56 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 670 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.59 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  41.25 
 
 		 658 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 625 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 		 652 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  48.23 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 675 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 627 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  44.44 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 		 674 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  37.97 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 		 621 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  48.51 
 
 		 549 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 652 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 667 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 819 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 671 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  41.53 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  40.12 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 		 675 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 		 671 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.78 
 
 		 707 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 		 626 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 628 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 657 aa  107  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>