More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2497 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
372 aa  758    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.08 
 
 
366 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
362 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
362 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  36.07 
 
 
362 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
362 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
362 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
362 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
362 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 
362 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
442 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
360 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  40.73 
 
 
362 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  39.68 
 
 
361 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  39.29 
 
 
367 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.89 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
351 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
351 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
352 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
352 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
352 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  35.06 
 
 
365 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  35.37 
 
 
365 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 
421 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
720 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 
635 aa  152  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
632 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  37.89 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
700 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 
447 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
720 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
700 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 
658 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 
483 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
674 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 
495 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  37.55 
 
 
375 aa  133  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  31.27 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 
645 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5250  hypothetical protein  29.89 
 
 
466 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869882  normal  0.134387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  34.11 
 
 
306 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  32.41 
 
 
458 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
852 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 
470 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623772  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  40.94 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  40.94 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
915 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  40.94 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
540 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  36.2 
 
 
623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  36.36 
 
 
1406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
1079 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.41 
 
 
701 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
982 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  41.76 
 
 
544 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 
975 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
548 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.58 
 
 
628 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.9 
 
 
671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 
664 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
626 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 
601 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
544 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  33.9 
 
 
421 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 
483 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  37.43 
 
 
623 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
839 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
636 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
695 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
542 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  55.66 
 
 
541 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3060  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
659 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.471114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  57 
 
 
541 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  56.19 
 
 
541 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 
622 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  59.34 
 
 
541 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.04 
 
 
518 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  37.75 
 
 
548 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.65 
 
 
879 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  53.21 
 
 
541 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  46.26 
 
 
544 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2843  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
397 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.565523  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 
1474 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
541 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 
544 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0205  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
669 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 
1475 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 
527 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2883  chemotaxis sensory transducer  60 
 
 
537 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.44547e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.63 
 
 
545 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>