More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1055 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 362 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.62 
 
 		 362 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.62 
 
 		 362 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.72 
 
 		 362 aa  742    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  82.83 
 
 		 362 aa  627  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.66 
 
 		 362 aa  620  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.38 
 
 		 362 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.87 
 
 		 362 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.44 
 
 		 362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.11 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.59 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  50.14 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  46.52 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  45.4 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  35.5 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 720 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 		 658 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 720 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 447 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  26.69 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 		 635 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 674 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 		 645 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.31 
 
 		 632 aa  113  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  33.7 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  33.18 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 622 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 		 641 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 700 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  31.69 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 815 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 700 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  41.1 
 
 		 629 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  41.78 
 
 		 629 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  41.1 
 
 		 632 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  41.1 
 
 		 632 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  44.03 
 
 		 626 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  41.1 
 
 		 629 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  41.1 
 
 		 629 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  37.21 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  34.47 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  48.36 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  55.29 
 
 		 627 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  30.03 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  60.98 
 
 		 563 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  46.61 
 
 		 672 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1836  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126283  normal  0.522282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 546 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4907  PAS  36.26 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.43 
 
 		 524 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  52.38 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 499 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  40 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.54 
 
 		 658 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 539 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 		 629 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 532 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40 
 
 		 628 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 539 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 628 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  52.94 
 
 		 480 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.04 
 
 		 545 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40 
 
 		 626 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  48.28 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  41.61 
 
 		 658 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  55.29 
 
 		 524 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 		 557 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 		 539 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 574 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 658 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  41.61 
 
 		 658 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5352  methyl-accepting chemotaxis protein  36.26 
 
 		 448 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 658 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 658 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  60.76 
 
 		 467 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  39.55 
 
 		 533 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  39.55 
 
 		 533 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.13 
 
 		 495 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 678 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>