More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0135 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.05 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  43.23 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  46.43 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40.8 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.87 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  45.07 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  46.21 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  41.76 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  41.42 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  45.19 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  44.27 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  41.42 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  41.42 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  39.41 
 
 		 194 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 219 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  44.7 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.36 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  40.27 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  41.48 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  45.08 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
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NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.74 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  41.79 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  43.38 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  37.14 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  41.91 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  31.44 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  34.18 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  39.06 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  39.06 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  34.65 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  36.11 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  35.76 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  35.76 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  40.44 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  39.71 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  35.71 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  38.76 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
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NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  38.67 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  30.17 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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