More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5771 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
273 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  79.49 
 
 
273 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2629  amino acid ABC transporter, permease protein  66.96 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane permease component  66.67 
 
 
264 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1136  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.58 
 
 
281 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.06 
 
 
226 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5172  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  54.98 
 
 
260 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3308  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 
283 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.87 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.75 
 
 
278 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8010  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
278 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0358711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 
237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  36.02 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2432  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.65 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
219 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  36.36 
 
 
501 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  32.88 
 
 
219 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.96 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  32.7 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  32.88 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2696  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.23 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 
222 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.71 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  33.19 
 
 
237 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  31.96 
 
 
222 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.51 
 
 
215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  32.86 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0092  amino acid ABC transporter permease  32.72 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  34.03 
 
 
714 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
224 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  32.58 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29470  amino acid ABC transporter membrane protein  38.12 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3464  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuC  34.4 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.64 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  33.83 
 
 
214 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
217 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
216 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
216 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
216 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.47 
 
 
235 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.93 
 
 
250 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.93 
 
 
250 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
234 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.41 
 
 
225 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0777  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.73 
 
 
218 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554294  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2697  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 
221 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  31.63 
 
 
216 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0911  amino acid ABC transporter permease  29.73 
 
 
265 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.312712  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0967  amino acid ABC transporter permease  33.19 
 
 
222 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027607  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  30.09 
 
 
250 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  28.71 
 
 
727 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.28 
 
 
214 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
216 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.22 
 
 
221 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5242  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
226 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  34.6 
 
 
223 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
219 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05951  ABC transporter ATP-binding/permease protein  32.27 
 
 
265 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 
219 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1541  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 
218 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00385329  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  32.27 
 
 
265 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
215 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1825  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.74 
 
 
262 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120265  normal  0.903781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
267 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.755534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.03 
 
 
333 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
218 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  33.65 
 
 
242 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
237 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
219 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
220 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3103  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.4 
 
 
274 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  32.63 
 
 
219 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2055  general L-amino acid ABC transporter permease protein  25.66 
 
 
365 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
216 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3409  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.37 
 
 
223 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
218 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 
343 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  33.01 
 
 
246 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  33.15 
 
 
216 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
216 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2154  Beta tubulin, autoregulation binding site  31.7 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 
215 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.31 
 
 
217 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2523  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  29.36 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4663  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.54 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0638635  normal  0.199282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
216 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 
218 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
216 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 
214 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>