More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3308 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3308  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
283 aa  557  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.41 
 
 
285 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1136  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.46 
 
 
281 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2629  amino acid ABC transporter, permease protein  47.93 
 
 
262 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane permease component  50.93 
 
 
264 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8010  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0358711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.68 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 
273 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
237 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5172  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  46.37 
 
 
260 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
226 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2432  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.24 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
503 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
489 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  36.11 
 
 
489 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.05 
 
 
219 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
489 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  32 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  33.47 
 
 
237 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.15 
 
 
250 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.15 
 
 
250 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 
215 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
209 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  27.73 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.66 
 
 
221 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4189  polar amino acid ABC transporter permease  32.38 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4163  polar amino acid ABC transporter permease  32.38 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
232 aa  95.5  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0233  amino acid ABC transporter permease  30.91 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.63 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
217 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 
232 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  32.86 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0294  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
233 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.198172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
217 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.973133  normal  0.345394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4215  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.09 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  30.32 
 
 
217 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  30.05 
 
 
209 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
217 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.96 
 
 
216 aa  92  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  29.63 
 
 
235 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 
217 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  29.63 
 
 
235 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  30.3 
 
 
727 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
209 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  29.63 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  29.63 
 
 
232 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3464  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuC  33.33 
 
 
219 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.95928  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 
219 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
209 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.7 
 
 
221 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
209 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  31.78 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  32.23 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.33 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  34.66 
 
 
216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.66 
 
 
216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.66 
 
 
216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.83 
 
 
216 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.55 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.58 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 
217 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0120  ABC-type amino acid transport system, permease component  29.86 
 
 
226 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6490  amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.52 
 
 
226 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598296  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.44 
 
 
222 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 
213 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
225 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
213 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
226 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  31.88 
 
 
222 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
222 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.65 
 
 
215 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
220 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.4 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0967  amino acid ABC transporter permease  27.98 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.63 
 
 
217 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  30.95 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4006  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.75 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>