More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1136 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1136  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2629  amino acid ABC transporter, permease protein  66.39 
 
 
262 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane permease component  71.62 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.79 
 
 
273 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.12 
 
 
226 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.95 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5172  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  55.51 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3308  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 
283 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8010  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0358711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
278 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2432  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.54 
 
 
279 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
209 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
217 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.73 
 
 
221 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
216 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
219 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  32.74 
 
 
222 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 
215 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3464  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuC  32.71 
 
 
219 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 
222 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
222 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 
234 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.86 
 
 
217 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 
216 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  34.88 
 
 
216 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 
216 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 
214 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 
219 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
214 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 
217 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  32.54 
 
 
242 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.73 
 
 
224 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  32.38 
 
 
219 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  29.81 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  29.81 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  29.81 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3556  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  35.05 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.849356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  29.33 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  32.08 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.84 
 
 
220 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  31.8 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.81 
 
 
214 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
214 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  34.34 
 
 
216 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
214 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
215 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
217 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  30 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0777  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.18 
 
 
218 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554294  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
213 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
222 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  34.72 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
219 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  29.02 
 
 
217 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  32.75 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.35 
 
 
214 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.6 
 
 
216 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3381  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
218 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.782136  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  30.63 
 
 
220 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
223 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.67 
 
 
235 aa  92.4  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.73 
 
 
218 aa  92.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  28.1 
 
 
727 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.27 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0591  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  30.96 
 
 
285 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4215  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  31.76 
 
 
246 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  29.9 
 
 
217 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 
225 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  27.73 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
216 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
219 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  31.9 
 
 
596 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3974  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.4 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4189  polar amino acid ABC transporter permease  31.4 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4163  polar amino acid ABC transporter permease  31.4 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
219 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.37 
 
 
492 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 
216 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  31.31 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
217 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>