More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8010 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8010  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
278 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0358711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  85.97 
 
 
278 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.95 
 
 
285 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3308  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
283 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
273 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2629  amino acid ABC transporter, permease protein  44.87 
 
 
262 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.13 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.49 
 
 
273 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1136  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.69 
 
 
281 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane permease component  46.79 
 
 
264 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5172  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  44.04 
 
 
260 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 
226 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2432  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.45 
 
 
279 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  30.32 
 
 
216 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  31.6 
 
 
214 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  29.69 
 
 
217 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
222 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
217 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
219 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 
217 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
214 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  31.13 
 
 
214 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  31.13 
 
 
214 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  31.13 
 
 
214 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 
219 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 
214 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  31.4 
 
 
220 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.52 
 
 
219 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0967  amino acid ABC transporter permease  30.48 
 
 
222 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 
214 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
216 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
220 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.04 
 
 
218 aa  99  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.02 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.83 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.24 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  29.81 
 
 
220 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.24 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 
214 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.82 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1431  amino acid ABC transporter permease  32.54 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  27.78 
 
 
250 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.49 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  31.08 
 
 
234 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
503 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 
219 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.18 
 
 
222 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.23 
 
 
220 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  31.19 
 
 
216 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  33.15 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  29.91 
 
 
219 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  31.65 
 
 
242 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  31.91 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.25 
 
 
598 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  31.91 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  28.51 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
503 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.1 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.54526  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  31.91 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  31.91 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
209 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
209 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.56 
 
 
216 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.56 
 
 
216 aa  89.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.15 
 
 
221 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2008  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 
222 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0198583  decreased coverage  0.00681365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
489 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
489 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0233  amino acid ABC transporter permease  26.79 
 
 
217 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.19 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  33.14 
 
 
489 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  33.33 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0120  ABC-type amino acid transport system, permease component  28.44 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2451  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.84 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.96 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.153152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4331  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.62 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1119  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.77 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.632094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>