More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2030 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
598 aa  1203    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.38 
 
 
596 aa  722    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.05 
 
 
596 aa  737    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  65.93 
 
 
596 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.52 
 
 
234 aa  232  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.48 
 
 
233 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  48.91 
 
 
233 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
230 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.81 
 
 
233 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0765389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.52 
 
 
237 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
229 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1431  amino acid ABC transporter permease  45.38 
 
 
230 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
236 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
231 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
231 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  44.09 
 
 
231 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 
256 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
252 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
240 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2256  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
240 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4527  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
232 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2055  general L-amino acid ABC transporter permease protein  42.4 
 
 
365 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
230 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
230 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
240 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
240 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.98 
 
 
240 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57318  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05400  amino acid ABC transporter transmembrane protein  36.32 
 
 
248 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.669152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  38.83 
 
 
230 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4330  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.98 
 
 
240 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152879 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4371  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
243 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2820  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  44.83 
 
 
359 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7628  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2824  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  44.83 
 
 
359 aa  165  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4544  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.26 
 
 
240 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424386  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.75 
 
 
240 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0691  amino acid ABC transporter permease  44.22 
 
 
231 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.522451  normal  0.944357 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7664  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  38.61 
 
 
250 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.64 
 
 
221 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
216 aa  161  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
252 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198232  normal  0.40329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2326  amino acid ABC transporter permease  42.18 
 
 
367 aa  160  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
216 aa  160  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 
233 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  38.33 
 
 
242 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02363  hypothetical protein  42.4 
 
 
365 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
231 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
394 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  38.33 
 
 
237 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003415  amino acid ABC transporter permease protein  42.38 
 
 
365 aa  156  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4395  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
366 aa  157  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2138  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
366 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
335 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
216 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
315 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0973  amino acid ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
365 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000454558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  42.16 
 
 
214 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 
216 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1631  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
227 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1758  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
384 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115192  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0681  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 
248 aa  154  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0358  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
242 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0871077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3618  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
401 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
214 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1561  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
384 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
214 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 
246 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.973133  normal  0.345394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2259  amino acid ABC transporter transmembrane protein  41.67 
 
 
230 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2496  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
401 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0938494  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.08 
 
 
242 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2914  glutamine ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
246 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
214 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4003  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 
403 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0400  amino acid ABC transporter permease  39.08 
 
 
242 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.123104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
251 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9239  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  37.13 
 
 
235 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.3 
 
 
320 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
214 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  41.18 
 
 
214 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0304  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltJ  37.39 
 
 
248 aa  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
214 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
320 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
214 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 
221 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 
214 aa  151  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.75 
 
 
320 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
245 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4044  ABC transporter permease  37.65 
 
 
248 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0975  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
365 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  40.87 
 
 
251 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  38.08 
 
 
242 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  40 
 
 
216 aa  150  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  42.02 
 
 
216 aa  150  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
320 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  40.89 
 
 
319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1456  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.68 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.242829  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0335  amino acid ABC transporter permease  36.97 
 
 
248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46920  putative permease of ABC transporter  37.25 
 
 
248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1074  amino acid ABC transporter permease  41.43 
 
 
365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0912852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0815  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
246 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  0.0721562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>