More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0115 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
285 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3308  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.98 
 
 
283 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2629  amino acid ABC transporter, permease protein  50.57 
 
 
262 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1136  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.77 
 
 
281 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8010  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.95 
 
 
278 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0358711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane permease component  54.21 
 
 
264 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.87 
 
 
273 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.32 
 
 
278 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.2 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.36 
 
 
226 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 
273 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5172  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  50.23 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2432  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.19 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.19 
 
 
219 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.85 
 
 
215 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
214 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
222 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.78 
 
 
503 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
215 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
217 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  29.41 
 
 
217 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
503 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 
217 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.83 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.83 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0233  amino acid ABC transporter permease  31.22 
 
 
217 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 
225 aa  95.9  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.95928  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  30.53 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  32.24 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0294  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.03 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.198172  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
219 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  32 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
219 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.94 
 
 
218 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  34.86 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  34.18 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.42 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
215 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  27.93 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 
215 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
219 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
218 aa  92.4  8e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.07 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4189  polar amino acid ABC transporter permease  31.9 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  32.64 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0967  amino acid ABC transporter permease  30.88 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027607  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0777  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 
218 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554294  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4215  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4163  polar amino acid ABC transporter permease  31.9 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1163  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.7 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  30.58 
 
 
220 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000364543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.96 
 
 
214 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 
225 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
220 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.3 
 
 
221 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 
596 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.5 
 
 
217 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
214 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  28.44 
 
 
485 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  26.19 
 
 
727 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  35.21 
 
 
215 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  32.86 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  32.23 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  31.28 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  31.78 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
596 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4273  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 
222 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 
225 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.76 
 
 
218 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 
225 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 
513 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.44 
 
 
485 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.04 
 
 
232 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.44 
 
 
485 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  30.8 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  30.33 
 
 
209 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.76 
 
 
223 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.973133  normal  0.345394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4593  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
242 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.733202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.69 
 
 
230 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 
219 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.32 
 
 
232 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>