More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3812 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  59.49 
 
 		 251 aa  261  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  55.11 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  42.92 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  43.16 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  40.17 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  27.9 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  32.19 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  36.41 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  32.48 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  37.5 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.91 
 
 		 277 aa  88.6  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.57 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.46 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.18 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.8 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.29 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.09 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.4 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.41 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  28.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  27.5 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.44 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.43 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25.3 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.02 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.06 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  30.83 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>