114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3410 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2324  hypothetical protein  39.82 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01638  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01628  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1884  hypothetical protein  25.41 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000419061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2382  hypothetical protein  24.42 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000742969  hitchhiker  0.00107532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1528  hypothetical protein  24.42 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000725408  hitchhiker  0.0000459629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1869  hypothetical protein  25.08 
 
 		 270 aa  86.3  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1973  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00561956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1962  hypothetical protein  25.87 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  36.99 
 
 		 1219 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  42.31 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  34.2 
 
 		 1055 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  33.76 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  36.26 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  44.9 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  42.25 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0282  hypothetical protein  24.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  38.41 
 
 		 936 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  33.13 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  35.1 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  33.13 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  34.17 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  35.33 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  33.75 
 
 		 582 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  38.89 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  38.82 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  32.72 
 
 		 842 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  32.94 
 
 		 951 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  31.74 
 
 		 867 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  39.19 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 706 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  34.67 
 
 		 1321 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  27.41 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  35.9 
 
 		 1451 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  32.21 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  38.06 
 
 		 1168 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  25.52 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  30.98 
 
 		 1297 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 934 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  38.32 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  40.14 
 
 		 712 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  30.98 
 
 		 1170 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  41.41 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  34.67 
 
 		 835 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  37.19 
 
 		 639 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  36.69 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  36.69 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  35.46 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  24.39 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  39.07 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  26.95 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  30.92 
 
 		 835 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  38.06 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  35.71 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1147 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  39.22 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  30.82 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  32.35 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  33.81 
 
 		 838 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.66 
 
 		 2851 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 542 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  34.5 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  34.5 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  30.41 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  36.27 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2245  hypothetical protein  22.3 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  33.76 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  27.44 
 
 		 400 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  36.61 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  23.39 
 
 		 613 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  27.87 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  32.35 
 
 		 493 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.72 
 
 		 2914 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  35 
 
 		 582 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  33.82 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  31.3 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1843  hypothetical protein  39.29 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2034  hypothetical protein  39.29 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00517956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  35.47 
 
 		 1580 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0595372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  27.34 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  31.93 
 
 		 645 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  33.08 
 
 		 439 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  26.54 
 
 		 767 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  23.17 
 
 		 2145 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  29.1 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  30.59 
 
 		 835 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  44.05 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  25.32 
 
 		 1287 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  32.95 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  37.5 
 
 		 1426 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  31.82 
 
 		 1101 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  24.15 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5722  hypothetical protein  33.85 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073489  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  35.54 
 
 		 451 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  35.92 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  31.73 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>