150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2272 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  583  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  69.78 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  68.95 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  68.95 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  63.06 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  62.5 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  60.94 
 
 		 289 aa  331  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  60.46 
 
 		 269 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  53.61 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  48.11 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  47.91 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  47.53 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  47.53 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  47.15 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  47.35 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  46.04 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  46.97 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  46.97 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  46.97 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  46.97 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  47.53 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  47.53 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  46.42 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  47.27 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  45.28 
 
 		 273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  44.91 
 
 		 267 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  44.53 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  43.98 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  45.08 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  42.8 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  38.7 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  39 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  35.06 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  37.98 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  39.76 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  31.23 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  35.41 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  32.48 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  29.92 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.25 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.25 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.98 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  28.22 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  26.56 
 
 		 444 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  26.26 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 571 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46290  poly(3-hydroxybutyrate) synthase subunit  52.08 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  24.87 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  44.26 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  32.82 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 		 254 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>