More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0178 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0178  sensor histidine kinase  100 
 
 		 596 aa  1242    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_167  sensor histidine kinase  84.76 
 
 		 589 aa  1042    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  86.1 
 
 		 597 aa  1073    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 392 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  31.36 
 
 		 392 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  30.12 
 
 		 1084 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 377 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.45 
 
 		 1070 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 534 aa  120  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  25.14 
 
 		 1070 aa  120  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0305  sensory box sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0171  sensory box sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 503 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 371 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 657 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.1 
 
 		 1629 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.97 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1057 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 1118 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 909 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 663 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 678 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1101 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 1046 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 926 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 763 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1312  sensor histidine kinase  31 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  25.57 
 
 		 1303 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1058 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.06 
 
 		 1120 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1043 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  26.97 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1433 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 2161 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  27.97 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1085 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 591 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 899 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  28.87 
 
 		 867 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  29.18 
 
 		 908 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 697 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 1255 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 1261 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  26.52 
 
 		 556 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 682 aa  104  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  29.7 
 
 		 742 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  28.57 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  26.98 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 901 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 1049 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 882 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 899 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 761 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 745 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 1516 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 701 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1333 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 969 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  28.27 
 
 		 1131 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 2153 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  31.9 
 
 		 526 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  26.92 
 
 		 955 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1053 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.1 
 
 		 1331 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 739 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 1559 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 382 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 1126 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3137  histidine kinase  29.88 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 		 912 aa  101  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 660 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 528 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 646 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 1029 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  29.49 
 
 		 906 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>