More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3137 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3137  histidine kinase  100 
 
 		 291 aa  583  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  66.17 
 
 		 298 aa  367  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  60.42 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  61.96 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0133  histidine kinase  56.65 
 
 		 482 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  59.16 
 
 		 718 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  52.73 
 
 		 603 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  43.46 
 
 		 616 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  41.99 
 
 		 583 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 1155 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 1155 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2265  histidine kinase  44.08 
 
 		 562 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.135939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1168 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1149 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 		 1141 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  39.54 
 
 		 565 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1038 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 1143 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 1158 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1155 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 1847 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 1843 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 1853 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 1165 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1037 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  40.38 
 
 		 560 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 1137 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 568 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 767 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1145 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 916 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  39.55 
 
 		 1170 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 1159 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 1917 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 		 1237 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 1023 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.32 
 
 		 896 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  39.93 
 
 		 1137 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 1163 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1177 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1214 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 2107 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  39.18 
 
 		 1172 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1964 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  38.75 
 
 		 576 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  37.63 
 
 		 1200 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 921 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1119 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  37.02 
 
 		 737 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 1482 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1406 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  35.57 
 
 		 1196 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 984 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 1816 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 717 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1356 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  39.67 
 
 		 729 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1195 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 2010 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  36.47 
 
 		 1278 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 1406 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1068 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  35.31 
 
 		 896 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  34.98 
 
 		 896 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1195 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 		 896 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  34.98 
 
 		 896 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  34.98 
 
 		 896 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  36.97 
 
 		 556 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 973 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 631 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 687 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  34.65 
 
 		 896 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 969 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1361 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 896 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1400 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  34.65 
 
 		 896 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 951 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1040 aa  168  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.25 
 
 		 1763 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  39.04 
 
 		 1392 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1159 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 575 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1954 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 770 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1942 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 		 896 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 1369 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 1458 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 1194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1768 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 1896 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1142 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.6 
 
 		 1361 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1771 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>