More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0478 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  100 
 
 		 560 aa  1096    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2265  histidine kinase  58.88 
 
 		 562 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.135939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  45.51 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  41.27 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  36.23 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0133  histidine kinase  37.09 
 
 		 482 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  37.33 
 
 		 718 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  41.3 
 
 		 299 aa  200  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  41.98 
 
 		 298 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3137  histidine kinase  40.38 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1853 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  38.7 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1155 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1843 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1155 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1847 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 1149 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1406 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.78 
 
 		 1346 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1003 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1917 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1160 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1022 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.31 
 
 		 1361 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 1163 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  37.12 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 823 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1155 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  32.93 
 
 		 985 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1479 aa  170  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 773 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 977 aa  170  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.72 
 
 		 987 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 923 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1839 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  28.34 
 
 		 1196 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  30.88 
 
 		 497 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1193 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 791 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1193 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 974 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 970 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1145 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1362 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37.21 
 
 		 1172 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1143 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.53 
 
 		 661 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 922 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1141 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1064 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  31.53 
 
 		 861 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 896 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  38.84 
 
 		 576 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1358 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1142 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 1195 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 870 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1003 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  36.3 
 
 		 1170 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  31.69 
 
 		 797 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1431 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 2010 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  30.32 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 975 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  28.51 
 
 		 896 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 1203 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 896 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1131 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 952 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  31.44 
 
 		 910 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1119 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1048 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1158 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 920 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1168 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 835 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 896 aa  160  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  28.73 
 
 		 896 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  31.27 
 
 		 742 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 917 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 		 631 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1070 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 781 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 1271 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  28.51 
 
 		 896 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  29.21 
 
 		 1161 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1237 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1352 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.84 
 
 		 1177 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 646 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 873 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  28.28 
 
 		 896 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 1695 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 927 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  31.9 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  34.07 
 
 		 919 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  28.28 
 
 		 896 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  28.28 
 
 		 896 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  30.35 
 
 		 845 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 902 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>